http://www5c.biglobe.ne.jp/~horoau/js_library/comma.htmlで公開されているソースを元に、JavaScriptのクラスを作成したので、配布します。

ダウンロード

メソッド名を、PHPで同様の機能を提供する関数「number_format()」と合わせたのと、マイナスにも対応しています。（だから、ほとんどパクリじゃんって突っ込まないで下さい。）

使用方法

head要素内等でprototype.jsと本スクリプトを読み込んでください。
あとは、以下のようなコードを記述すると、戻り値にコンマがつけられます。

 var str = 1111; // 値は数値型でも文字列型でも可
 alert( str.number_format() ); // 1,111

不明な点がありましたら、コメントに書き込んでいただければ、なるべく早くご回答します。

ライセンス

MITライセンスとします。
ただし、気に入っていただけた方からの寄付は歓迎します。